黑蒜中带有的大蒜素具备广谱抗菌效果，它对十几种流行病毒及多样发病微生物菌种都有着清杀效应。起杀菌作用的成分主要是大蒜素，再有一种白色油脂性液体“硫化丙烯”[（CH2CH2H2）2S]。这类大蒜素即使稀释10万倍仍能在瞬间杀死伤寒杆菌、痢疾杆菌、流感病毒等。黑蒜的挥发性物质、浸出液及蒜素在试管内对多样致病菌都有着清晰的抑制或清杀效应。这些含硫化合物对腐败真菌也有很强的抑制和清杀效应，其效应强度相对于甚至强于化学防腐剂苯甲酸、山梨酸，是发觉的植物提取中抗菌效应最强的一种。